لا تُؤثر متلازمة القولون العصبي بشكل مباشر على صحة الجهاز التناسلي، ولا يوجد أي دليل علمي يؤكّد ارتباط هذا المرض بالجهاز التناسلي؛ فهو مرض مزمن يصيب الأمعاء والمعدة ويؤثر في وظيفتها، ولكنه قد يزيد من خطر الألم المصاحب للدورة الشهرية (عسر الطمث)، وخطر الإصابة بمتلازمة ما قبل الحيض.
ورغم أنه لا يؤثر على الخصوبة بشكل مباشر، إلا أنه قد يؤثر على الرغبة الجنسية خلال وقبل الجماع لدى بعض المصابات المتزوجات؛ الأمر الذي ينجم عن الشعور بالألم المزمن الذي يتداخل مع شتّى نواحي الحياة، أو الشعور بالتعب على نحو شبه دائم.
كما أنّ بعض المصابات بالقولون العصبي قد يشعرن بألم مهبلي أثناء العلاقة الزوجية، ولكنّه لا يؤثر على وظائف الجهاز التناسلي أو بُنيته، كما أنه من النادر أن يُسبب أي من هذه الأعراض، فلا داع للقلق.
ولكن يجدر الذكر أن بعض الأدوية الموصوفة لعلاج متلازمة القولون العصبي قد تؤثر على الخصوبة، لذلك يفضل استشارة الطبيب المختص.